光合儀既可在葉室（反應器）中進行測定，也可以直接在室外使用，所以它是活體、離體皆可測量。匹配各種類型的葉室（反應器），就可以適用于各種植物葉片、種子、昆蟲等不同測量對象。葉室對于光合儀測定分析有重要的輔助作用。在很多測定試驗中技術人員會測試光合儀在空葉室條件下的數據是何呢？

　　空葉室即葉室中不加入任何葉片，該測定主要是測試光合儀在空葉室條件下的凈光合速率A。空葉室的凈光合速率值A可以反映整個光合作用測量系統性能的優劣。通常，我們使用差分式的測量方法計算葉片的凈光合速率A。如下式中，通過測定參比腔室和樣品腔室CO2濃度，利用其差值來計算A。在測量時，既要保證系統進氣的穩定，由CO2r來反映；又要保證夾葉片腔室不漏氣，由CO2s來反映；由于這兩個值由兩套分析器分別測量，還要保證兩者的一致性。例如在空葉室條件下，兩者差值的理論值為0。

　　差分式：

　　A=Flow[CO2r-CO2s（1000-H2Or/1000-H2Os）]/100*Leaf Area。

　　利用這一點，就能毫不費力的測量羽量級樣品的光合氣體交換，如陰生植物葉片、微小葉片，或是暗呼吸速率。